De hecho al principio de 2002 fuertes rumores empiezan a circular: la disquera de Jackson está furiosa con él debido a su decisión de dejar Sony. Según esta versión todas las grabaciones de sencillos se han paralizado (incluido el que se pensó como obra de caridad para las victimas del S11), las estaciones de radio se niegan a transmitir canciones incluidas en el último álbum, nadie menciona a Michael ya, el álbum se deja caer después de vender 7 millones de copias en tres meses. Los rumores circulan, Michael firma contratos con cuatro compañías disqueras diferentes. Nadie cree lo que está pasando. Sony niega todo. Algunos entusiastas empiezan a reaccionar despertando protestas contra el gigante de la industria musical. Otros clubes de fans permancen silenciosos porque piensan que no es correcto interferir en el negocio de la disquera. Hay una gran confusión por todas partes. El nuevo video "Unbreakable", el hit que habría generado ciertamente 5 o 6 millones de copias más que "Invincible", es continuamente pospuesto. De enero a febrero, de febrero a abril, de abril a junio, y de junio a nunca... Las muchedumbres y fans del mundo se organizan por todas partes y sacan sus propios demos de los sencillos, en Sony están calientes, "sin comentario" contestaron, "Michael Jackson no es más un artista de prioridad para nuestra compañía". Finalmente, en junio de 2002, Michael decide hablar, y su declaración pica. En Londres, durante "The Killer-Thriller Party", Michael acusa a Sony de obstruccionismo contra él. Michael explica que Sony está furiosa con él debido a su decisión de dejar la compañía, llevándose el 50% del catálogo de ATV (los derechos de algunas de las canciones más famosas de Elvis y Los Beatles), decidiendo estropear su carrera, boicoteando su nuevo álbum.

Pero los problemas de Michael no han terminado. En el relaunch de su carrera y superando las decisiones de su compañía disquera, él decide producir un documental sobre su vida privada y artística. Siguiendo la sugerencia de Yuri Geller, él acepta abrir las puertas de Neverland al reportero británico Martin Bashir, bien conocido por sus entrevistas a personas famosas como a Lady Diana, Louise Woodward, Michael Barrymore, Charles Ingram, y Joanne Lees. El documental despierta vivo interés en las redes internacionales y el Canal británico ITV empieza a vender los derechos para transmitirlo al principio de 2003.

Pero el documental provoca reacciones contradictorias y lo que se suponía que sería un modo de venganza para el Rey se vuelve una derrota más. Michael se prepara para tomar una nueva acción legal contra ITV Channel y contra el reportero que fue acusado de poner al popstar ante el público en una luz desventajosa con la edición del documental. Esta edición también es la causa principal de algunas malinterpretaciones sobre la vida sexual del popstar, principalmente a causa de un muchacho que aparece en la entrevista con Michael, y que va a ser la causa de otros problemas mas adelante. Eso no es todo, Michael tiene que llevar a cabo un nuevo documental, lo transmite por el mundo, conteniendo las partes de la entrevista no incluidas en el documental de Bashir.

Sin embargo el grito causado por este evento es positivo para Michael, porque sus álbumes reingresan en el Hit Parade y rompe records de ventas. En la ola del éxito, Sony y Epic deciden revisar de nuevo los más grandes hits incluyendo todos los singles, eso logró la cima del Hit Parade internacional; para esta nueva publicación Michael graba una nueva canción escrita por R. Kelly: “One More Chance”, (“Una Oportunidad Más”).

“One More Chance” aparece en septiembe de 2003 e inmediatamente entra en las carteleras y tiene éxito vendiendo seis millones de copias. En el entretanto Michael empieza la grabación del video del sencillo a ser transmitido por cadenas internacionales. El álbum “Number Ones”, se emitió el 18 de noviembre de 2003, se produce con cuatro tapas diferentes, y se agreaga a una colección de videos en DVD con el mismo título. El álbum entra en las carteleras del mundo y confirma el talento de Michael como un autor y actor conocido mundialmente.

Pero el lanzamiento del álbum se acompaña por una pesadilla dramática que siempre ha seguido a Michael en su mundo mágico: el espectro de los cargos por molestia de niños. Se rumora que Thomas Sneddon, abogado del distrito de Santa Bárbara, va a empezar una investigación sobre el comportamiento de Michael. Michael es acusado una vez más por molestra sexualmente a un niño, la pesadilla del proceso regresa, y los medios de comunicación enloquecen.

El 16 de noviembre de 2003 poco antes del lanzamiento del álbum “Number Ones”, sale un video de policíacas haciendo una búsqueda completa en el rancho de Michael en California, buscando las pruebas de su culpabilidad. Una vez más la vida de Michael y su carrera está en las manos de jueces y su futuro depende de las declaraciones de un adolescente. De pronto parece regresar a 1993 cuando aparecieron los primeros cargos de molestia a niños. Sin embargo ahora los medios de comunicación son más agresivos e intrusos, y se preparan para condenarlo.

Michael es arrestado al bajar del avión, él decide cooperar con la policía en las investigaciones para lograr un pago judicial, una fianza, inmediatamente. Ahora él toma la determinación de acabar con la materia. Las fotos de Michael esposado y llevado a la policía, circulan por el mundo, así como sus fotografías de identificación. Él es liberado tras pagar una fianza y desde ese momento su vida se vuelve una prueba que se acaba sólo dos años después.

El proceso empieza al principio de 2005 y después de cuatro meses el veredicto se entrega. El 13 de junio de 2005 Michael Jackson es encuentrado inocente. Al final de este interminable tormentó judicial, su vida ve cambios: Michael decide dejar los Estados Unidos y se muda al Medio Oriente.

Desaparece durante muchos meses, nadie sabe donde esta. En el entretanto su pasado parece desaparecer poco a poco, Producciones MJJ se disuelve y el personal es despidido. Neverland es cerrado. Pero unos meses después Michael reaparece en Barhain, como invitado del sultán, y piensa crear una nueva compañía disquera.

En 2006 Sony lanza la enésima aventura comercial con respecto a Michael Jackson y decide publicar una nueva caja de colección titulada “Visionary”. Incluye los mejores 20 sencillos de la carrera de Michael contenida en un formato innovador, el Disco Dual, en un lado el CD de audio con la versión del álbum y en el otro lado el DVD con el video.